故事的主人公韋小寶（李小飛 飾），一個刁鑽聰敏的年輕人，他從小跟隨母親居住在揚州妓院。他因爲幫助天地會抵抗清兵而闖下了大禍，被老太監私自帶入宮中並冒充小太監。在宮中，韋小寶與少年皇帝康熙（周紹棟 飾）成了親密無間的朋友，兩人之間有着深厚的友情。他們聯手打擊了宮中的奸臣，幫助康熙消滅了成宮中的紅人。　　然而，韋小寶的生活變得更加複雜。他誤打誤撞成爲了天地會總舵主的弟子，並被要求刺殺康熙，這讓他感到左右爲難。韋小寶無意中發現神龍教的計劃，他們派遣人冒充太后潛伏在宮中多年，企圖盜取大清的命脈——藏寶圖。真正的太后則被囚禁。康熙與韋小寶聯手，冒險救出了太后。