《剿殺令》講述瞭解放前夕，國民黨不甘失敗，留下部分部隊軍火和特務潛伏在黔東地區，聯合當地土匪爲反攻作準備。黔東地區土匪借勢橫行，當地名不聊生。 天台寨匪首熊山虎逼迫布依少女陸翠珍做壓寨夫人，陸翠珍爲了逃避，只能匆匆與當地的首富莫家少爺莫志明成親。熊山虎對此耿耿於懷。決意血洗莫家莊…… 莫六姑因覺財產分配不公，對莫志明懷恨在心，更是對機敏能幹的陸翠珍恨之入骨；熊山虎便勾結六姑好設計陷害莫志明夫婦。莫志明中毒身亡，陸僥倖逃過一劫，熊山虎欲趁機侵佔莫家莊，但棋遜一招，反被陸一舉殲滅。巧取天台寨後，陸成爲布依山區首領，與得力干將覃天建立了深厚感情，但由於世俗的門規，覃默默的離開了家鄉。 黔東解放後，解放軍着手剿匪行動，國民黨特務了達到目的，暗殺布依山區長老陸文澤，並放出風聲：共產黨已下達“剿殺令”，將剿滅所有的“土匪”。陸翠珍對解放軍誤會極深，她率衆進入山區深處，亡命山林。負責前來剿匪行動的正是覃天，他現在已是解放軍裏的一名排長，爲了喚回對解放軍正確的認識和昔日感情，他隻身潛入山林…