在電影開始開篇，場景好像被設置在一片大森林中。在森林內, 一聲強力的呼救被一個叫Yukinari的男孩聽到了。Yukinari是一個在殘酷社會中比較天真的男孩，但這次經歷對他來說是可能使他終身受益。 　　當他進入森林的時候,他遇見一個叫Mika的少女。Mika大概是森林的監護人, 而且與 Celebi（雪拉比）很要好。一些伐木工人給這裏帶來了麻煩，Yukinari將幫助Mika擺脫這些伐木者。這時Mika向Yukinari解釋了森林現在存在的危險，以及他們必須在有限的時間內尋找她所需要的某個答案。突然，雪比拉出現了，將他們帶入了40年後的時代。 　　在那裏，他們遇見了我們的英雄（主角）Ash，Misty和Brock。而且，好像Ash和Yukinari還有某種血緣關係。與此同時，火箭隊的成員之一Bisashu也在積極的尋找着雪比拉。這個男人帶着一個金屬頭盔站在...