鯉之助已經離去很久了，自由也漸漸忘卻了以前刺激的經歷，但短暫的和平氣氛隨着一個矮小身軀的神祕人出現在自由家而宣告結束。此人正是鯉之助的孩子鮎之助，拿着心型眼帶，爲了未來的戰鬥再次追隨着父親的足跡。而曾經的對手，現在是自由朋友的御影也因擔心自由的安危來到她的身邊保護她。自由的學校中，新轉來一個日俄混血的女孩：菲利莎。誰也沒想到這個可愛活潑的女孩竟然是柳生十兵衛的親女兒。她爲了奪回第二代十兵衛的頭銜與心型眼帶，接近自由。表面上與自由親熱無比，暗底下卻包藏禍心。正當自由身邊危機迸發之際，柳生同門的另一宿敵：柳生喜多烈齋的後人又來搗亂。自由將如何決定自己的未來呢？