SIDE6沉浸在一片安宜祥和的氣氛中，這裏遠離戰場，幾乎從未發生過什麼戰事，駐守在這兒的聯邦軍的部隊也並不多，這一點，並不使少年阿魯高興，因爲他是一個軍事迷，渴望看一下激烈的戰鬥場面。一日阿魯正與朋友們交流時，殖民地內發生了騷動，這是由吉恩的小股偵察部隊與聯邦發生的衝突所引致，不久，一架受了傷的扎克（改），掠過阿魯的上空，墜落在離他不遠的林間草坪上。被擊落的吉恩新兵巴尼，用自己的軍銜章換取了阿魯的攝影機磁卡，這裏面記錄有阿魯從聯邦的工廠裏到的MS組裝畫面。此外，還有幾日前從地球搬來的阿魯家的鄰居紅髮女郎克麗絲的倩影。巴尼獲取的情報，引起了吉恩軍的注意，他們立即組建了一支突擊小隊，執行破壞高達的任務。於是，巴尼所在的小隊，依靠一場小規模的戰鬥的混亂，再度潛入SIDE6。在宇宙殖民地中，巴尼又一次與阿魯相遇。理想成爲MS駕駛員的少年阿魯，自願爲吉恩突擊小隊偵察聯邦軍的祕密基地的位置，並與監視他的青年巴尼成爲了好友。一日，巴尼在阿魯的窗下與克麗絲邂逅，這爲巴尼的監視任務帶來一分情趣。同時，在突擊小隊的祕密倉庫中，對高達用新型MS--坎普瑪正在組裝中，計劃在聖誕節前，完成破壞阿歷克斯的任務。一切準備工作完成後，破壞高達作戰展開，由吉恩老兵駕駛的坎普瑪，將駐守的聯邦部隊打得落花流水，並與突擊小隊配合，很快到達了停放阿歷克斯的祕密工廠，阿歷克斯NT-1倉促應戰，並以性能的優勢將坎普瑪擊敗。至此，吉恩突擊小隊作戰失敗，小隊除巴尼以外全員戰死。吉恩突擊小隊作戰失敗後，小隊唯一倖存者巴尼接到了立即撤離SIDE6的指示。因爲吉恩軍沒有機會再組織力量破壞高達，於是他們打算聖誕夜之前，用核彈摧毀整個宇宙殖民地。巴尼得知消息後，要求阿魯立即通知家人與克麗絲儘早離開殖民地，但遭到阿魯的反對。阿魯希望自己心中的優秀駕駛員巴尼，能擊潰阿歷克斯挽救殖民地的命運，於是巴尼只得一個獨自離開。警方無法相信阿魯的報警，置之不理。同時，吉恩軍搭載核彈頭的攻擊艦已駛離母艦。阿魯面對朋友與家人幾欲絕望，此刻在機場，巴尼正猶豫不決，最終，他下定決心，爲了阿魯與心愛的克麗絲，以及殖民地的人們，向阿歷克斯發出最後的挑戰。在阿魯的協助下，他修復了初次襲擊SIDE6時被擊落的扎克，用唯一的武器--能量斧對NT-1發起了攻擊。與此同時，阿魯從父親的口中得知了吉恩軍將於數日後簽定終戰協議，他飛奔着跑向巴尼戰鬥的地方，但在他面前支離破碎的NT-1的光束劍，已刺穿了扎克的座艙。而救護人員從NT-1的座艙中搶救出的聯邦駕駛員那一頭秀麗的紅髮，更使阿魯呆然……