劇情康熙十九年，清朝平定“三藩”叛亂的戰爭歷時七年，已經取得決定性的勝利，康熙皇帝在養心殿大宴百官，氣氛熱烈，施琅起身向皇帝起奏，國家尚未統一，慶祝爲時尚早，建議平叛軍隊全線東移，大兵壓陣，解決臺灣問題。施琅的奏疏遭到反對。康熙二十年，侍衛馮錫範和唐妃互相勾結，在臺灣北園別館製造骨肉相殘的同時，挾持年幼的延平王鄭克塽，控制檯灣大權，他們持海自固，多次拒絕清廷招撫和談，陰謀“自立乾坤”。董太妃以年邁之軀，支撐着臺灣風雨飄搖的局面，凜然宣佈：“自立乾坤，分裂國土，我至死不爲！若有再提自立乾坤者，殺無赦！”從臺灣進入京城的朱霖、阿鰻串小巷潛行到施琅家府，匆匆交給施世倫一封信，便消失在夜幕中。當晚兩人均被九門提督捕獲。次日，京城午門木榜告示：經刑部審議明日斬首臺灣奸細朱霖、阿鰻。施琅聞訊十分震驚，決定以一位內大臣身份闖刑場。“臺灣奸細案”和“施琅闖入刑場案”果然驚動朝廷，康熙皇帝發出諭旨：在刑部審訊施琅，宣諭貝勒奈溚、康親王傑書爲審理官。九月五日施琅被押進刑部大堂，他大聲呼喊：暗通關節者，朝廷確有其人，但不是施琅，而是貝勒奈溚，並從懷中取出書信高聲喊道，這封書信就是兩年前貝勒奈溚寫給臺灣馮錫範的，在信裏，貝勒奈溚允許臺灣自立乾坤，康熙皇帝的突然到來，令刑部大廳堂的人全都驚呆。康熙皇帝怒斥：誰敢分裂江山社稷，應和臺灣自立乾坤者，此劍爲例。施琅與奈溚從此結下私仇。內太臣施琅因剿寓撫，以戰逼和的對臺方略，得到朝廷重臣李光地等人的支持，康熙皇帝十分賞識，起用施琅爲福建水師提督。施琅提請侍衛吳奇爵同行並申述其理由，康熙皇帝允諾。施琅抵達福建上任，引起臺灣馮錫範自立乾坤的主要追隨者洪旭等人的不安和驚恐，密議應對之策，幾天後劉國軒出征前往澎湖，準備以戰爭決勝負。康熙二十一年三月施琅在制定進取澎臺的作戰方案時，與福建總督姚啓聖產生了全面的分歧。八月康熙皇帝在“御門聽政”早朝中，把“進軍澎臺”的專征權交給了施琅。出征前夕，施琅將全家十幾口少不更事的孩子，派送各條戰船，以示征戰的決心。康熙二十二年六月，施琅指揮戰船三百多艘，將領士卒三萬多人從銅山港出發，乘南風之勢，進軍澎湖。澎湖決戰，經過五個時辰的激烈戰鬥，以清軍的勝利而結束。澎湖失守，水軍覆沒，臺灣失去屏障，延平王召集百官商議臺灣的去向，百官批駁了“血戰到底”和洪旭的“棄島計劃”，同意了劉國軒提出議和則保全，再戰必覆滅的觀點，年幼的延平王鄭克塽在關鍵時刻果斷決定，由劉國軒負責與清廷議和。八月十三日，施琅率精兵登陸鹿耳門，直抵龍亭。八月十五日，臺灣歸清的隆重典禮在孔廟門前廣場舉行，施琅宣諭了康熙皇帝對臺灣歸順清朝的聖詔。八月二十二日施琅拜謁鄭成功祠，焚香頂禮含淚祭告，神情愴然。康熙二十二年十一月，鑑於臺灣權力移交已經完成，施琅和他的船隊順利回到廈門。鄭克塽被清廷授予爵位，其親屬也被授予三品、四品官職，劉國軒則被授予天津總兵。康熙二十三年四月，皇帝下詔，臺灣設一府三縣，下令屯兵鎮守臺灣。施琅繼續留任福建水師提督。康熙三十五年二月，施琅病逝，享年七十六歲。