與現實略有不同的地球。地球正遭受來自“紅之世界”的侵略者【Nightfly O'Note】的威脅。人類爲了與之對抗，而設立了對相位外防衛機關【LAG】，並組成對Nightfly O'Note戰鬥單位【Scared Rider】，即使在過去的五次戰鬥中重蹈全滅的覆轍，依然繼續戰鬥着。不久之後，一名少女麻黃明以教官兼指揮官的身份前往LAG赴任，剛一到任，停止的Nightfly O'Note侵襲再度開始了。第六戰鬥單位【Scared Rider Xechs】的成員們，爲了與明一同守護世界，而投身於戰場。這是她與少年們的愛與友情與戰鬥的物語。