這是一場被加爾德羅貝封印的戰爭。講述風華王家之祕，和愛莉卡的母親＝雷娜·塞亞斯的故事。憧憬着乙HiME的少女＝西弗爾。某一天，魔手襲擊了在無依無靠的同時仍堅強生存着的她。謎之組織「希巴魯茲」們拐走了西弗爾。在危急時刻，將她救出的是黑衣紳士＝布魯斯，他的女僕(?)＝蕾娜，紫苑修女和她的乙HiME＝Meister拉凱爾，以及五柱·一之柱=艾利奧特。少女西弗爾之謎。擁有乙HiME力量卻將其拒絕的蕾娜。加爾德羅貝之謎。五柱的背叛。現在，正是先代乙HiME覺醒之時。標題中的“S.ifr”包含了兩層意思：其一，它在阿拉伯語中是0的意思；其二，它也提示了作品中的主要角色西弗爾・布蘭（Sifr Flan）。