一家跨國製藥公司“葛安公司”，與國內某沿海城市合作興建了一座大型生物工程基地。西海醫院院長徐謙，感覺到葛安在醫院下屬的肝病醫療中心幹着某種非法藥物實驗的勾當，但對方組織極其嚴密，違法活動不着痕跡。徐謙又發現葛安的人還意圖竊取自己的導師、在世界流行病領域享有盛譽的肝病中心主任凌知淵正在祕密研究的某項重大科研成果(“黑鬱金香”病毒研究)。職責和良知讓徐謙決定查出黑幕。而最有效的辦法就是讓黑幕的操作者信任自己。此時，徐謙發現自己患了一種不治之症——肌肉萎縮症。他知道最多半年時間，他就將躺在病牀上，而最多兩年時間，他將辭別人世。徐謙義無反顧地上了葛安公司的“賊船”，經過一場對方精心策劃的“考試”後，徐謙成了生物工程基地的CEO……葛安公司斷定凌知淵手上的祕密研究具有極大的商業價值。於是他的女兒、高級流行病學專家凌子墨被從在國外的葛安總部派回了西海。她的身份是生物工程基地高級顧問，但總部的祕密意圖，是讓她慢慢接近其父手中的祕密研究，助其父一臂之力，並在她自己不知情的情況下，將醫學情報透給葛安……凌子墨回到西海，發現自己深愛的徐謙變得世俗、陌生甚至可怕。此種情形下，凌子墨與以前的戀人、一個因嫉惡如仇頗具個性而顯得不合時宜的律師汪曉寒漸漸走得較近，徐謙爲了讓自己深愛的女友能在自己死前重新找到感情歸宿，刻意做出一些不近情理傷害凌子墨的事，令凌子墨痛苦萬分。與魔共舞的徐謙，忍受着女友和導師朋友同事的誤會，忍受着身體的痛苦和心靈的折磨，將收集到的犯罪分子們的罪證，以“蜘蛛俠”的網名不斷給凌子墨發去電子郵件，指引凌子墨慢慢勘破其中的種種“懸機”。徐謙成了一個特殊的臥底和兩面人，他想通過這樣的方式裏應外合讓凌子墨汪曉寒等人將犯罪黑幕大白於天下。“黑鬱金香”病毒即將大面積爆發，凌知淵和凌子墨父女二人聯手攻關，欲搶在病毒爆發前徹底破譯它的基因密碼。一場對黑鬱金香科研成果的爭奪戰開始傾於白熱化。葛安不惜代價不擇手段要獲取凌知淵父女的基因圖。而最後黃雀在後的竟是凌知淵的助手、一個表面醫術平平實則是此中高手的虞雅琴！當凌子墨等人終於意識到蜘蛛俠其實是徐謙時，徐謙爲了保護黑鬱金香的珍貴資料和虞雅琴等人展開了殊死搏鬥，最後壯烈犧牲……依據徐謙提供的重要證據，西海市市長一聲令下，葛安公司的罪犯們被依法逮捕，無一漏網……而人們敬仰的醫學專家凌知淵，爲了搶救病人自己感染了病毒，獻出了生命……美麗的海濱墓地前，人們絡繹不絕地前來憑弔英雄，大海亦爲之動容……